Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
U3KQE9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
U3KQE9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
U3KQE9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
U3KQE9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms