Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms