Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E1

WASHC2C, WASH complex subunit 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2CQ9Y4E1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
WASHC2CQ9Y4E1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
WASHC2CQ9Y4E1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
WASHC2CQ9Y4E1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms