Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CHTOPQ9Y3Y2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CHTOPQ9Y3Y2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms