Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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HCN4Q9Y3Q4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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HCN4Q9Y3Q4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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HCN4Q9Y3Q4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
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HCN4Q9Y3Q4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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HCN4Q9Y3Q4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HCN4Q9Y3Q4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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