Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TPRKBQ9Y3C4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms