Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SBNO2Q9Y2G9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SBNO2Q9Y2G9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms