Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DTX4Q9Y2E6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DTX4Q9Y2E6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms