Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD1Q9Y239 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms