Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HPS5Q9UPZ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HPS5Q9UPZ3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms