Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CEP164Q9UPV0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CEP164Q9UPV0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms