Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRIM35Q9UPQ4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRIM35Q9UPQ4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms