Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PHF8Q9UPP1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms