Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHA12Q9UN75 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHA12Q9UN75 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms