Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SYNPO2Q9UMS6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SYNPO2Q9UMS6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms