Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM73

ALK, ALK tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKQ9UM73 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ALKQ9UM73 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ALKQ9UM73 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms