Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNRF3Q9ULT6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNRF3Q9ULT6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms