Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTC7AQ9ULT0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms