Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
MKLN1Q9UL63 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
MKLN1Q9UL63 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms