Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV5

AMFR, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMFRQ9UKV5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AMFRQ9UKV5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AMFRQ9UKV5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms