Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TSPAN16Q9UKR8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TSPAN16Q9UKR8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms