Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
POLKQ9UBT6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
POLKQ9UBT6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms