Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
USP36Q9P275 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
USP36Q9P275 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms