Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PHRF1Q9P1Y6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PHRF1Q9P1Y6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms