Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KCMF1Q9P0J7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KCMF1Q9P0J7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms