Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
EHD3Q9NZN3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
EHD3Q9NZN3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms