Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMOD3Q9NYL9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMOD3Q9NYL9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms