Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CMTM6Q9NX76 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms