Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
PDS5BQ9NTI5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PDS5BQ9NTI5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PDS5BQ9NTI5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms