Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SALL1Q9NSC2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SALL1Q9NSC2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms