Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT82Q9NSB4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT82Q9NSB4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms