Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNBIP1Q9NSA3 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNBIP1Q9NSA3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms