Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS98

SEMA3G, Semaphorin-3G, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3GQ9NS98 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SEMA3GQ9NS98 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms