Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LTBP3Q9NS15 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTBP3Q9NS15 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
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