Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNNM1Q9NRU3 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNNM1Q9NRU3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms