Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NIT2Q9NQR4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms