Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RTN4Q9NQC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RTN4Q9NQC3 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms