Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LHX9Q9NQ69 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LHX9Q9NQ69 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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