Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KIAA1549Q9HCM3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms