Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLXNA4Q9HCM2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLXNA4Q9HCM2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms