Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
USP29Q9HBJ7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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