Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SENP3Q9H4L4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC018635.1-201ENST00000468292 1030 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC005066.1-201ENST00000613582 1007 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC020656.1-201ENST00000548900 599 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AL355432.1-201ENST00000522960 564 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SENP3Q9H4L4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms