Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PARLQ9H300 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PARLQ9H300 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms