Protein–RNA interactions for Protein: Q9H267

VPS33B, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS33BQ9H267 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VPS33BQ9H267 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VPS33BQ9H267 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms