Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC113Q9H0I3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC113Q9H0I3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms