Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
COMMD5Q9GZQ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COMMD5Q9GZQ3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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