Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTNAP4Q9C0A0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTNAP4Q9C0A0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms