Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

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Length 932 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EDEM3Q9BZQ6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EDEM3Q9BZQ6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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