Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
YTHDF1Q9BYJ9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms