Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SALL3Q9BXA9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SALL3Q9BXA9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms